¿Puede el contribuyente rectificar una autoliquidación si advierte un error que le perjudica?

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Sí. Si una autoliquidación perjudica de cualquier modo los intereses legítimos del obligado tributario, este puede instar su rectificación. Pero debe comprobar primero la normativa del impuesto y del período: cuando esa normativa establece la autoliquidación rectificativa, la corrección debe presentarse mediante el modelo correspondiente; en los demás casos se sigue el procedimiento de solicitud de rectificación (artículo 120.3 y 4 de la Ley General Tributaria, LGT).

En el procedimiento de solicitud, la autoliquidación original debe haberse presentado y, como regla general, la rectificación debe pedirse antes de que la Administración practique la liquidación definitiva o prescriba su derecho a determinar la deuda. No cabe pedirla mientras se tramite una comprobación o investigación que incluya esa misma obligación tributaria. Si ya existe una liquidación provisional, solo cabe por motivos distintos de los que fueron objeto de esa liquidación (artículo 126.2 y 3 del Real Decreto 1065/2007).

La Administración dispone de un máximo de seis meses para notificar la resolución. Transcurrido ese plazo sin notificación expresa, la solicitud puede entenderse desestimada a efectos de poder recurrir (artículo 128.4 del Real Decreto 1065/2007). Por tanto, no es correcto afirmar que el silencio se produce a los tres meses.

Si la rectificación da lugar a una devolución, pueden proceder intereses de demora: se aplican reglas distintas según se trate de una devolución derivada de la normativa del impuesto o de un ingreso indebido (artículos 120.3 y 32.2 LGT). Si la rectificación solo reduce lo que queda por ingresar y no genera devolución, se mantiene la obligación de pagar hasta el nuevo importe resultante (artículo 120.3 LGT).